Филармония была создана в 1936 году и является крупнейшей концертной организацией в Кыргызстане. Общее руководство Филармонией было поручено композитору, российскому деятелю музыкальной культуры В.Фере. Первыми артистами были выдающиеся музыканты - М.Куренкеев, К.Орозов, Ы.Туманов, А.Байбатыров, С.Бекмуратов, Ч.Иманкулов; певцы М.Баетов, А.Огонбаев, М.Омурканова; акыны К.Акиев, А.Усенбаев, О.Болебалаев, Ы.Борончиев, Ш.Термечиков; манасчы С.Каралаев, М.Мусулманкулов и др.
В 1939 г. за достойный вклад в развитие национальной культуры Филармония была удостоена Ордена Трудового Красного Знамени. В честь 65-летия, со дня рождения Т.Сатылганова, в 1940г. ей было присвоено имя великого акына. Привлекая для работы лучших музыкантов, комузистов, киякчи, солистов и танцоров были созданы творческие коллективы: Киргизский государственный оркестр народных инструментов, ансамбль народного танца «Ак-Марал», фольклорно-этнографический ансамбль «Камбаркан», ансамбли комузистов и темир-комузистов, хоровая капелла, камерный оркестр, эстрадные группы «Семетей» и «Наристе», музыкальный лекторий, студия эстрадных исполнителей.
С 1980г. Филармония находится в уникальном здании, с Большим залом, на 1.108 посадочных мест, который оснащён модифицирующей сценой, современным техническим оборудованием, Малым органным залом на 314 мест, просторными фойе, служебными и репетиционными помещениями. В декабре 2001г. Указом Президента КР УП за № 364 Филармонии присвоен статус Национальной.
Ежегодно Филармония гостеприимно принимает гостей из разных государств и стран. За последнее время с большим успехом прошли концерты классической музыки симфонических оркестров и оркестров народных инструментов под управлением Народных артистов СССР: Ю.Симонова, Е.Светланова, Д.Китаенко, В.Гергиева, Д.Кахидзе, А. Ведерникова, а также сольные концерты музыкантов с мировым именем - Д.Хворостовского, Е.Дога, Д.Мацуева, Е.Михайлова. А.Володоса, С.Стадлера, Е.Румянцева, Д.Горновского, Г.Гродберга, М.Плетнева, С.Доренского. Своё искусство и мастерство демонстрировали дирижёры камерных и симфонических оркестров – В.Спиваков (Россия), В.Кристи, (Германия), Ч.Ансбахер(США), Р.Макмеррин(США), Д.Шпигельман(США). Радовали зрителей своим вокальным исполнением Народные артисты СССР, России: И.Архипова, В.Пивко, С.Ведерников, Е.Образцова, И.Кобзон, Т.Синявская, Л.Лещенко, О.Газманов, А.Днишев, В.Леонтьев, С.Ротару, Р.Рымбаева, С.Захаров, Г.Гнатюк, И.Аллегрова, Р.Ибрагимов, В.Толкунова. Горячими аплодисментами зрители встречали популярные вокально-инструментальные ансамбли: «Сябры», «Самоцветы», «Ялла», «Весёлые ребята», «Песняры», оркестр из Японии, участников Международного джазового фестиваля «Джаз. Бишкек. Весна» и др. коллективы.
Никого не оставили равнодушными артисты сатиры - Е.Петросян, Р.Карцев, Г.Хазанов, В.Винокур. М.Грушевский. Непередаваемую атмосферу высокого искусства и профессионализма создали на сцене Филармонии: Большой театр России, Московский Малый театр, художественный театр МХАТ, Московский театр оперетты, а также Петербургская хоровая капелла им. Глинки, хор им. Пятницкого, Московский хор им. Юрлова, Кубанский казачий хор, Уральский хор, хор Турецкого. На высоком уровне прошли концертные выступления артистов балетной труппы из Франции, Государственного ансамбля народного танца СССР И.Моисеева и Государственных ансамблей танца: «Жок» (Молдавия), «Гульдор» (Казахстан), «Берёзка» (Россия), Киевского ансамбля песни и плясок.
Здесь проходят многие премьеры произведений мировой и национальной классики, авторские концерты композиторов Кыргызстана и стран Центральной Азии. Музыкальной и исполнительской основой Кырнацфилармонии всегда остаются великие кыргызские композиторы, корифеи кыргызской культуры - А.Джумахматов, Н.Давлесов, К.Молдобасанов, творчество которых берёт своё начало в бесценных произведениях Токтогула.
В настоящее время в Филармонии работают 10 творческих коллективов. Коллективы и солисты Филармонии ежегодно гастролируют с концертами по республике и за её пределами. Принимают участие в Международных фестивалях, конкурсах ближнего и дальнего зарубежья, пропагандируя музыкальное искусство Кыргызстана и способствуя сотрудничеству между странами.